Najczęstszą przyczyną występowania poronień samoistnych są wady w budowie chromosomów płodu.
Wówczas to sama natura odrzuca te zarodki, które nie mogłyby się prawidłowo rozwinąć i nie miałyby szans na przeżycie.
Poronienie samoistne to reakcja organizmu kobiety prowadząca do wydalenia w całości ( poronienie całkowite) lub w części (poronienie niecałkowite) elementów jaja płodowego z macicy przed 20. tygodniem ciąży.
Przedwczesne zakończenie ciąży występujące z przyczyn naturalnych może być spowodowane wadami rozwojowymi jaja płodowego ( co stanowi przyczynę ponad połowy poronień samoistnych). Często zdarza się i tak, że za poronienia samoistne jest odpowiedzialny organizm mamy. Wady w budowie narządu rodnego kobiety, choroby zakaźne (chlamydioza, toxoplazmoza, zakażenie HSV, różyczka, listerioza), choroby przewlekłe powodujące stałe pogarszanie się stanu zdrowia kobiety (m.in. cukrzyca), czynniki psychiczne, niehigieniczny tryb życia ( alkohol, papierosy i inne używki) – oto główne powody występowania poronień samoistnych.